提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

海南一母亲将男婴遗弃草丛被判刑******url:https://m.gmw.cn/2022-12/28/content_1303237359.htm,id:1303237359

　　近日，海南省乐东黎族自治县人民法院宣判了一起遗弃罪案件，以遗弃罪判处被告人卢某有期徒刑一年，缓刑一年三个月。

　　2020年5月份之前，被告人卢某与张某认识并同居。同年10月，卢某产下一名男婴后将其遗弃在路边一处土堆草丛里。当日早上，该弃婴被附近村民发现并送至医院，医护人员遂报警。2021年3月，经民警电话通知，卢某主动到抱由派出所接受调查。经鉴定，卢某、张某是弃婴所属的生物学父母亲。乐东县法院认为，被告人卢某产下新生婴儿将其遗弃草丛里，情节恶劣，已构成遗弃罪。案发后，被告人卢某主动到案并如实供述自己的罪行，系自首，愿意接受处罚，且本案婴儿年幼。根据被告人卢某的犯罪性质、情节、认罪悔罪表现及对社会的危害程度，遂作出上述判决。（全媒体记者邢东伟翟小功 通讯员徐莎莎）